Управителен съвет:
Управител: Милен Димитров
Организационни звена :
Група основни дейности - Ръководител доц. Маруся Любчева
Група конференции- Ръководител д-р Сабина Георгиева
Група експерти проекти – Ръководител Милен Димитров
Група организиране на партньорства – Ръководител доц. Дончо Керемидчиев
ЦИПО – Директор доц. Маруся Любчева
Черноморски Институт има подписани партньорски споразумения със следните организации:
- Фондация "Аве-Мария" - Констанца - Румъния
- Асоциация "Обединени Експерти"
- Асоциация "Българска земя"
- Асоциация "Дунавски диалог"
- Бургаската търговско-промишлена палата
- Бургаската туристическа камара
- БАУРЧР
